- 受理決定接獲申訴之日起 10 個工作日（第10條）
- 系統登錄受理翌日起 7 個工作日，並通知申訴人（第11條）
- 調查小組100人以上，受理起 15 個工作日（第14條）
- 調查報告小組成立後 2 個月，得延長 1 個月（第17條）
- 作成決定報告完成後 1 個月；未滿30人3個月、30–99人4個月（第18、21條）
- 紀錄留存3 年（第26條）
規模決定義務
| 僱用勞工人數 | 主要義務 |
|---|---|
| 10人以上 | 設置申訴管道並於工作場所顯著處公開揭示（第5條） |
| 30人以上 | 另應訂定防治措施、申訴與懲處規範、指定專責單位並公開揭示；實施教育訓練（第6條）；設申訴處理單位，至少3位、任一性別不少於1/3（第9條） |
| 100人以上 | 另應於受理之日起15個工作日內組成調查小組（第14條） |
人數以受僱從事工作獲致工資者計算；事業分散於不同地區者，以各地區單位分別計算（第3條）。
受理與不受理
申訴得以言詞、電子郵件或書面提出；以言詞或電子郵件提出者，受理人員應作成紀錄並確認內容（第8條）。雇主應於接獲申訴之日起10個工作日內決定是否受理並以書面通知；不予受理應敘明理由（第10條）。受理翌日起7個工作日內，應依公告方式登錄系統，並通知申訴人（第11條）。
得不予受理的情形：非屬職場霸凌事項、無具體內容、未具真實姓名或足以辨別身分之資訊、同一事件已不受理或已終局處理、已撤回、已逾申訴期限（第10條第2項）。
知悉後的立即措施
因申訴而知悉時，應考量申訴人意願採取隔離等措施且不得不利對待、依需求提供或轉介法律、醫療或心理等協助、啟動調查，並依結果對行為人適當懲戒或處理（第7條）。非因申訴而知悉時，亦應訪談釐清並告知被霸凌勞工得主張的權益。
協調
申訴人有意願者得進行協調；協調人員應經當事人同意，任一方無意願，或自協調之日起逾一個月未有共識時，應停止協調並續行調查（第13條）。調查過程的協調期間，不計入調查報告期限（第17條）。
調查
- 調查小組（100人以上）：至少3人，外部專業人士不少於1/2，任一性別不少於1/3；內部成員應接受至少3小時防治教育訓練（第14條）。
- 迴避：本人為當事人或有法定親屬關係者應自行迴避；有偏頗之虞者，當事人得申請迴避（第15條）。
- 程序：書面通知、訪談以錄音或錄影輔助並作成紀錄、不得令當事人對質、保全證據、身分保密（第16條第1項）。
- 期限：調查小組成立後翌日起2個月內完成調查報告，必要時得延長1個月並通知當事人（第17條）。
決定、懲處與申復
申訴處理單位至遲於報告完成之日起1個月內作成決定，須有成員1/2以上出席、出席者過半數同意（第18條）。決定後10個工作日內以書面通知當事人並告知申復方法及期限。
職場霸凌行為經調查屬實者，雇主應視情節輕重對行為人為適當之懲戒或處理，但行為人已離職者，不在此限；情節輕重應審酌身心侵害程度、次數與手段、雙方關係與事後態度、對事業單位的影響等（第19條）。當事人得於收到通知翌日起30日內申復一次（第22條）；申訴處理單位應自申復審議會議召開日起30日內作成附理由之決定，如屬應再行調查者，得展延30日；雇主應於申復決定日起10個工作日內以書面通知申復人及申復事件相對人（第23條第1項）。
未滿30人的雇主，應自接獲申訴翌日起3個月內作成決定；30至99人為4個月；必要時均得延長1個月並通知當事人（第21條）。
處理結果亦應於決定作成之日起10個工作日內登錄系統（第19條第3項）。當事人向主管機關或勞動檢查機構申訴，經認定違反準則且調查程序有重大瑕疵者，得要求雇主重新調查，雇主不得拒絕（第24條；職業安全衛生法第22條之2第5項）。雇主並應追蹤、考核及監督懲處措施的執行，檢討防治規範（第25條）。
紀錄與其他
預防措施、受理、協調、調查與申復的處理過程及結果，應作成執行紀錄並留存3年（第26條）。涉及工作場所性騷擾者，應各依相關準則辦理並避免重複詢問（第27條）。施行前已發生、施行後受理的事件，依新規定終結（第28條）。
罰則
| 情形 | 罰鍰（新臺幣） | 依據 |
|---|---|---|
| 未採取立即有效措施、未依規定調查處理或登錄等（部分情形須經通知限期改善屆期未改善） | 3萬 – 75萬，得加重至112.5萬 | 職業安全衛生法第45條 |
| 違反防治義務或立即有效措施，致勞工發生職業病或工作相關疾病 | 5萬 – 300萬，得加重至450萬 | 同法第43條第1項第3款 |
| 最高負責人經認定有職場霸凌之行為 | 1萬 – 100萬 | 同法第46條第1項 |